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A manipueira é uma água residuária proveniente da produção de farinha de mandioca com elevada carga poluente e tóxica, que pode contaminar cursos d''água e os solos, se não for corretamente descartada. Por outro lado, a produção de farinha é uma importante fonte de renda, sobretudo para pequenos agricultores familiares que, em geral, não têm recursos necessários para tratar esse efluente antes de descartá-lo. Uma usina foi implantada na cidade de Lajedo/PE com o intuito de produzir etanol a partir da manipueira. Este trabalho teve como objetivo a otimização operacional da produção de biodiesel usando álcool de manipueira e óleo vegetal de algodão. O biodiesel foi produzido na usina de Caetés/PE gerenciada pelo Centro de Tecnologias Estratégicas do Nordeste - CETENE. O etanol passou por um processo de purificação que contou com destilação azeotrópica e desidratação por glicerol a fim de se obter álcool anidro. O biodiesel produzido se mostrou de excelente qualidade com teores de éster acima de 98%.