Análise Genética por ARDRA-PCR da região ITS de Bacillus spp. obtidos de Solos da Região Oeste do Paraná

Análise Genética por ARDRA-PCR da região ITS de Bacillus spp. obtidos de Solos da Região Oeste do Paraná

SCHERER, ANDERSON JOSÉ; SILVA, THAÍS LUFT DA; NAVROSKI, DEISEI; APPEL, RENAN JOSÉ CASAROTTO; KOCK, KAMILA; ANDRADE, DIVA DE SOUZA; BARREIROS, MARCO ANTONIO BACELLAR; GRANGE, LUCIANA

Artigo Completo:

O solo é habitat de bactérias promotoras de crescimento em plantas (BPCPs). Dentre as mais estudadas, o Bacillus se destaca no controle de doenças do filoplano e de pós-colheita. O presente trabalho teve como objetivo analisar geneticamente bactérias do gênero Bacillus spp., nativas de solo sob diferentes manejos de cultivo e sistema natural da região oeste do Paraná, visando o reconhecimento de novas estirpes com potencial para agentes de biocontrole. Foram analisadas 25 estirpes utilizando a técnica de ARDRA-PCR da região intergênica (ITS) 16S-23S do rDNA empregando a clivagem com três endonucleases do tipo II. A distribuição das estirpes selecionadas foi bastante homogênea entre os agrupamentos formados indicando alta diversidade. O manejo de horticultura apresentou o maior número de representantes e o manejo agropastoril foi o que apresentou a maior diversidade.

O solo é habitat de bactérias promotoras de crescimento em plantas (BPCPs). Dentre as mais estudadas, o Bacillus se destaca no controle de doenças do filoplano e de pós-colheita. O presente trabalho teve como objetivo analisar geneticamente bactérias do gênero Bacillus spp., nativas de solo sob diferentes manejos de cultivo e sistema natural da região oeste do Paraná, visando o reconhecimento de novas estirpes com potencial para agentes de biocontrole. Foram analisadas 25 estirpes utilizando a técnica de ARDRA-PCR da região intergênica (ITS) 16S-23S do rDNA empregando a clivagem com três endonucleases do tipo II. A distribuição das estirpes selecionadas foi bastante homogênea entre os agrupamentos formados indicando alta diversidade. O manejo de horticultura apresentou o maior número de representantes e o manejo agropastoril foi o que apresentou a maior diversidade.

Palavras-chave:

DOI: 10.5151/biochem-vsimbbtec-22169

Referências bibliográficas

• [1] BAIS, H. P; LOYOLA, V. M. V.; FLORES, H. E, VIVANCO, J. M. Root specific metabolism: the biology and biochemistry of underground organs. In vitro Cell Dev Biol Plant, vol. 37, p. 730–741, 2001.
• [2] BUCHANAN, R. E.; GIBBONS, N. G. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 8.ed. Baltimore: The Willians & Wilkens, 1268 p.,1975 .
• [3] COELHO, L. F. In: Interação de Pseudomonas spp. e de Bacillus spp. com diferentes rizosferas. IAC – Instituto Agronômico. Campinas – SP. 2006.
• [4] COKMUS, C.; CIHAN, A. C.; TEKIN, N.; Ozcan B. The genetic diversity of genus Bacillus and the related genera revealed by 16s rRNA gene sequences and ARDRA analyses isolated from geothermal regions of urkey. Brazilian Journal of Microbiology. p.309-324, 2012.
• [5] CRUZ, L. M.; DE SOUZA, E. M.; WEBER, O. B.; BALDANI, J. I.; DOBEREINER, J.; PEDROSA, F. D. 16S ribosomal DNA characterization of nitrogen-fixing bacteria isolated from banana (Musa spp.) and pineapple (Ananas comosus (L.) Merril). Applied and Environmental Microbiology, Washington, vol. 67, n. 5, p. 2375-2379, 2001.
• [6] FRITZ, L. L.; BERLITZ, D. L.; MACEDO, V. R. M.; MACHADO, V.; FIUZA, L. M. Frequência de Bacillus spp. em solos de diferentes sistemas de cultivo de arroz irrigado em Cachoeirinha, RS. Bragantia, Campinas, vol. 69, n. 2, p. 405-412, 2010.
• [7] LAGACE, L.; PITRE, M.; JACQUES, M.; ROY, D. Identification of the bacterial community of maple sap by using amplified ribosomal DNA (rDNA) restriction analysis and rDNA sequencing. Applied and Environmental Microbiology, Washington, vol. 70, n. 4, p. 2052-2060, 2004.
• [8] LIMA, F. F. DE. Bacillus subtilis e níveis de nitrogênio sobre o desenvolvimento e a produtividade do milho. Programa de Pós-Graduação em Agronomia do Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Piauí. Teresina, PI. 2010.
• [9] MARIANO, R. L. R.; SILVEIRA, E. B.; ASSIS, S. M. P.; GOMES, A. M. A.; NASCIMENTO, A. R. P.; DONATO, V. M. T. S. Importância de bactérias promotoras de crescimento e de biocontrole de doenças de plantas para uma agricultura sustentável. Academia Pernambucana de Ciência Agronômica, vol. 1, p.89-111, 2004.
• [10] MONTEIRO, A. L. R.; CAMPOS NETO, J. R. M.; BITU, P. I. M.; ROZARIO, W. C.; OLIVEIRA, L. J. M. G.; RODRIGUES, A. A. C. Potencial antagonista de Bacillus ssp. sob diferentes métodos de avaliação in vitro no controle de Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici. Tropical Plant Pathology, vol. 38, agosto 2012.
• [11] NARDI, S.; CONCHERI, G.; PIZZEGHELLO, D.; STURARO, A.; RELLA, R.; PARVOLI, G. Soil organic matter mobilization by root exudates. Chemosphere, vol. 5, p. 653–658, 2000.
• [12] NAVARRO, E.; SIMONET, P.; NORMAND, P.; BARDIN, R. Characterization of natural populations of Nitrobacter sp. using PCR/RFLP analysis of the ribosomal intergenic spacer. Arch. Microbiol. vol. 157, p. 107–115, 1992.
• [13] REIS JUNIOR, F. B. dos; REIS, V. M.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Restrição do 16S-23S DNAr intergênico para avaliação da diversidade de Azospirillum amazonense isolado de Brachiaria spp. Pesq. agropec. bras., Brasília, vol. 41, n. 3, p. 431-438, 2006.
• [14] SAMBROOK, J.; RUSSELL, D. W. Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Hardor Laboratory Press, Cold Spring Hardor, New York, 2001.
• [15] VINCENT, J. M. Manual for the practical study of root nodule bacteria. Oxford: Blackwell, 164p, 1970.

Como citar:

SCHERER, ANDERSON JOSÉ; SILVA, THAÍS LUFT DA; NAVROSKI, DEISEI; APPEL, RENAN JOSÉ CASAROTTO; KOCK, KAMILA; ANDRADE, DIVA DE SOUZA; BARREIROS, MARCO ANTONIO BACELLAR; GRANGE, LUCIANA; "Análise Genética por ARDRA-PCR da região ITS de Bacillus spp. obtidos de Solos da Região Oeste do Paraná", p-220-223. In: In Anais do V Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia - VSIMBBTEC [=Blucher Biochemistry Proceedings].. São Paulo: Blucher, 2015.
ISSN 23595043, DOI 10.5151/biochem-vsimbbtec-22169