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O risco da escassez energética nas próximas décadas tem impulsionado a pesquisa pela busca de uma produção sustentável do hidrogênio, como a fotofermentação utilizando um substrato, como o melaço de soja. As bactérias fotossintetizantes são capazes de converter ácidos orgânicos ou biomassa em hidrogênio na presença de luz e em condições anaeróbias, nesse contexto destacam-se Rhodopseudomonas palustris e Rhodobacter capsulatus. O presente trabalho mostra uma produtividade de 6,87 mmol H2/L.dia para as R. palustris 34% maior que as R. capsulatus.