Setembro 2018 vol. 1 num. 5 - XXII Congresso Brasileiro de Engenharia Química

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ANÁLISE CRÍTICA DE METODOLOGIAS BASEADAS EM FLUXÔMICA PARA ESTIMAÇÃO DE CONTRIBUIÇÕES DOS MODOS DE FLUXOS ELEMENTARES

NAKAMA, C. S. M ; GOMEZ, J ; G. C, ; LE ROUX, G. A. C ; , ;

Pôster:

Modos de fluxos elementares são uma importante análise do metabolismo celular. Por representarem vias que mantêm a rede metabólica em estado estacionário, qualquer distribuição de fluxos de um sistema em estado estacionário pode ser representada como uma combinação linear desses modos. Diante disso, alguns autores propuseram metodologias para estimar a contribuição de cada modo elementar para uma distribuição de fluxos. Neste trabalho, um estudo de caso utilizando o metabolismo central da E. coli para avaliar o desempenho de quatro metodologias é apresentado. Os resultados mostram que não é possível garantir que esses métodos resultam em contribuições que de fato representam o estado fisiológico do microrganismo, já que o espaço de soluções é amplo e as respostas obtidas são arbitrárias.

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Palavras-chave: metabolismo celular,

Palavras-chave:

DOI: 10.5151/cobeq2018-PT.0879

Referências bibliográficas
  • [1] LEIGHTY R, ANTONIEWICZ M. Complete-MFA: complementary parallel labeling experiments
  • [2] technique for metabolic flux analysis. Metab. eng, v. 20, p. 49–55, 2013.
  • [3] POOLMAN G, VENKATESH K, PIDCOCK M, FELL D. A method for the determination of flux in
  • [4] elementary modes, and its application to Lactobacillus rhamnosus. Biotechnol. Bioeng, v. 88, n. 5, p.
  • [5] 601–612, 2004.
  • [6] SCHUSTER S, HILGETAG C. On elementary flux modes in biochemical reaction systems at steady
  • [7] state. J. Biol. Syst, v. 02, n. 02, p. 165–182, 1994.
  • [8] SCHWARTZ J, KANEHISA M. A quadratic programming approach for decomposing steady-state
  • [9] metabolic flux distributions onto elementary modes. Bioinformatics, v. 21, n. suppl. 2, p. 204–205,
  • [10] 2005.
  • [11] WIBACK S, MAHADEVAN R, PALSSON B. Reconstructing metabolic flux vectors from extreme
  • [12] pathways: Defining the α-spectrum. J. Theor. Biol, v. 224, n. 3, p. 313–324, 2003.
  • [13] ZHAO Q, KURATA H. Maximum entropy decomposition of flux distribution at steady state to
  • [14] elementary modes. J Biosci Bioeng, v. 107, n. 1, p. 84–89, 2009.
Como citar:

NAKAMA, C. S. M; GOMEZ, J; G. C, ; LE ROUX, G. A. C; , ; "ANÁLISE CRÍTICA DE METODOLOGIAS BASEADAS EM FLUXÔMICA PARA ESTIMAÇÃO DE CONTRIBUIÇÕES DOS MODOS DE FLUXOS ELEMENTARES", p. 3322-3325 . In: . São Paulo: Blucher, 2018.
ISSN 2359-1757, DOI 10.5151/cobeq2018-PT.0879

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