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A manipueira é uma água residual da produção de farinha de mandioca com elevada carga poluente e tóxica, que pode degradar cursos d''água e os solos, se não for corretamente descartada. Por outro lado, a produção de farinha é uma importante fonte de renda, sobretudo para pequenos agricultores familiares que, em geral, não têm recursos necessários para tratar esse efluente antes de descartá-lo. Com investimentos da ordem de R$ 800 mil, a usina da cidade de Lajedo/PE produz etanol para consumo. Este trabalho teve como objetivo simular uma planta piloto para a produção de biodiesel com etanol proveniente da manipueira e óleo de algodão. Foi utilizado o software Aspen para as simulações. Os resultados foram comparados com o biodiesel produzido na usina de Caetés/PE na qual é gerenciada pelo Centro de Tecnologias Estratégicas do Nordeste - CETENE. As simulações mostraram uma conversão de 99% em éster, o que atende ao padrões da ANP (Agência Nacional do Petróleo).